Налоговая инспекция России в данный момент находится на последнем этапе своего реформирования. Главные меры по совершенствованию налоговой системы, направленные на ее упрощение, повышение справедливости и экономической обоснованности взимаемых налогов и сборов, а также на понижению налоговой нагрузки были осуществлены в 2001-2005 годах.

Например, за эти годы были приняты и вступили в действие 17 глав второй части Налогового кодекса Российской Федерации, регулирующих порядок уплаты конкретных федеральных, региональных и местных налогов и сборов, а также специальных налоговых режимов.

Государственная налоговая инспекция получила окончательно сформированную структуру. Реформирование московской налоговой инспекции осуществлялось в тесной увязке с проведением бюджетной реформы и существенными изменениями в системе межбюджетных отношений налоговой инспекции РФ.

Поэтому главное внимание в московской налоговой инспекции в 2006 году уделялось мерам по совершенствованию налогового администрирования, направленных на пресечение имеющейся практики уклонения от налогообложения путем использования имеющихся недоработок в законодательстве о налогах и сбора и на гарантирование законных прав налогоплательщиков, которые повышают их защищенности от неправомерных требований налоговых органов, а также создание для налогоплательщиков комфортных условий для выплаты налогов и сборов.

Принятый Федеральный закон от 27.07.2006 № 137-ФЗ "О внесении изменений в часть первую и часть вторую Налогового кодекса Российской Федерации и в отдельные законодательные акты Российской Федерации в связи с осуществлением мер по совершенствованию налогового администрирования" вносит изменения в упорядочение налоговых проверок и документооборот, улучшение условий для самостоятельного и добросовестного исполнения налогоплательщиками конституционной обязанности по уплате налогов и сборов, расширение законодательно закрепленных гарантий соблюдения прав и законных интересов налогоплательщиков налоговой инспекции Москвы.